Das IAI beherbergt nicht nur Europas größte Spezialbibliothek zum ibero-amerikanischen Kulturraum mit über 1 Mio Büchern, sondern auch umfangreiche Sondersammlungen. Dazu gehören unter anderem die Kartensammlung, die Fotothek und die Nachlässe. Ihre Bestände stellen wichtige Quellen der Forschung dar und werden von Wissenschaftler*innen aus der ganzen Welt genutzt. Dies ist meist mit einer Reise nach Berlin und langen Arbeitstagen in den Sonderlesesälen des IAI verbunden. Inzwischen stehen aber immer mehr Bestände auch online zur Verfügung: In verschiedenen Projekten, aber auch als Teil der systematischen Digitalisierung am IAI werden historische Karten, Fotos auf Glasplatten oder Papier sowie persönliche Nachlässe gescannt, elektronisch erschlossen, mit weiteren Daten angereichert und in die Digitalen Sammlungen eingespielt. Um bei den insgesamt über 78.000 Karten, 100.000 Bildträgern und 300 Nachlässen des IAI Prioritäten für die Digitalisierung zu setzen, orientiert man sich vor allem an der Relevanz für die Forschung, aber auch an ihrem unikalen Charakter („was gibt es nur im IAI?“) und am konservatorischen Zustand der Materialien.